Я тут подумал, что даже если это и глюк, то яндекс вполне может под видом глюка вести вполне определенную стратегию. Сайт не забанен, но нет тех страниц, с которых надо бы продавать ссылки. Вот теперь сидеть и ждать, пока Яндекс снова всё проиндексирует. Поведение яндекса в этом случае очень логично.
врядли, не надо канонизировать яНДЕкс...